藻類

 絶滅（1種）

イケダシャジクモ

 絶滅危惧Ⅰ類（9種）

ニセウシケノリ

イバラオオイシソウ

アツカワオオイシソウ

インドオオイシソウ

アサクサノリ

オキチモズク

シマチスジノリ

フサコケモドキ

トガリフラスコモ

 絶滅危惧Ⅱ類（13種）

オオイシソウ

カワモズク

ケコナハダ

チスジノリ

ハナヤナギ

カラクサモク

コバモク

ヒナイワズタ

キザミズタ

イチイズタ

テングノハウチワ

ウスガサネ

シャジクモ

 準絶滅危惧（22種）

チャイロカワモズク

アオカワモズク

ハイコナハダ

イソモッカ

アマクサキリンサイ

トサカノリ

リュウキュウオゴノリ

アヤギヌ

ホソアヤギヌ

ツクシホオズキ

タニコケモドキ

ヤバネモク

ホソバロニア

マガタマモ

タンポヤリ

クロキズタ

イトゲノマユハキ

ヒロハサボテングサ

フササボテングサ

ナガミズタマ

カサノリ

タネガシマアマノリ

 情報不足（16種）

ウミフシナシミドロ

キリンサイ

アケボノモズク

ヌルハダ

コナハダモドキ

ホソバノガラガラモドキ

フイリグサ

アツバノリ

カタメンキリンサイ

ビャクシンキリンサイ

トゲキリンサイ

ベニゴウシ

エツキアヤニシキ

ヒメヤハズ

クビレズタ

スズカケモ